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医院倚重科教兴院、人才强院战略,锻造出综合实力国内厉害、享誉海内外的精品品牌——神经科学集群:神经内科是重点学科,中华医学会神经病学分会主任委员单位;神经外科和北京脑血管病中心是重点学科主要参加单位;功能神经外科被国际机构命名为“卓越成就临床中心”;康复医学科在神经康复领域国内领先;中医科、神经内科在老年神经病学和中西医结合脑病调节方面具有特色;设在宣武医院的北京市神经内科会诊中心荟萃国内厉害的神经病学高年资教授群,是神经系统疑难疾病的“高级诊断机构”;神经影像学、神经病理学、神经电生理学和神经药理学均在国内处于领先水平。北京市癫痫诊疗中心、北京市血管超声诊断中心也具有很高学术水平和知名度。
医院其他学科协调发展,各具特色,而且该院血管外科由我国血管外科学专家、中科院院士汪忠镐教授和院长张建教授领衔,是国内该学科领军团队之一;普通外科、血液科是北京市重点建设学科;心血管内科、心脏外科、胸外科、耳鼻咽喉-颅底外科、疼痛科、皮肤性病科和泌尿外科等,在国内均具有相当实力和特色。